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2012年7月26日 (木)

CELLに細菌の全遺伝子を使ってその一生をシミュレーションで実行した論文がでてます。すごいね。

これがセルに出ていた論文。

http://www.cell.com/abstract/S0092-8674(12)00776-3

"A Whole-Cell Computational Model Predicts Phenotype from Genotype"

”いかに複雑な表現型が個々の分子とそれらの相互作用から生じるかを理解することは、コンピュータによるアプローチに取り組む体制が整っている生物学にとって非常に重要なチャレンジである。この論文では人間の病原体のマイコプラズマ・ゲニタリウム(525個の遺伝子を持つ)の一生の全細胞のコンピュータモデル(全ての分子構成要素と相互作用を含む)について報告する。モデルは1900個の実験的なパラメータ(900本の他の論文に含まれる)を含む。”ということらしいですよ。

論文のpdfファイルはこちら。

http://covertlab.stanford.edu/publicationpdfs/mgenitalium_whole_cell_2012_07_20.pdf

さらになんと、著者がその結果をyoutubeにアップしてる!!!

というか著者の方、ソースコードとか全部公開してるみたい。

Whole-Cell Computational Model of Mycoplasma genitalium

https://simtk.org/project/xml/downloads.xml?group_id=714

すごいね。

生物に関してはど素人なのでこれがどれほどインパクトのある結果かはよくわかりませんが、これでグレッグ・イーガンの小説の世界(人間の全情報をデジタル化してコンピュータ上に置く)に少し近づいた!

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